CRISPR 基因编辑、克隆筛选与功能验证全流程

设计并实施基因敲除、定点编辑或调控实验,建立具有基因型、蛋白和功能证据的工程化细胞模型。

实验目的

设计并实施基因敲除、定点编辑或调控实验,建立具有基因型、蛋白和功能证据的工程化细胞模型。

适用范围与实验要求

  • 样本:永生化细胞系
  • 样本:原代细胞
  • 样本:干细胞和类器官
  • 样本:其他经评估的体外模型
  • 难度与耗时:高级,约 2–8 周
  • 安全:遵守重组 DNA、病毒载体和细胞材料相关审批与生物安全规范;编辑细胞仅用于获批的科研用途。

标准工作流程

  1. 确认编辑目标和功能终点
  2. 设计并预筛多条向导 RNA
  3. 优化细胞状态和递送条件
  4. 实施编辑并设置完整对照
  5. 在合适时间检测编辑效率
  6. 分离单克隆或富集目标群体
  7. 完成基因型、转录和蛋白验证
  8. 使用独立克隆和救援实验验证表型

设备、试剂与耗材

  • 设备:细胞培养系统、电转或其他递送设备、PCR 与测序设备、单细胞克隆和成像设备
  • 试剂:Cas 蛋白、mRNA 或表达载体、sgRNA 或 crRNA:tracrRNA、供体模板(按需)、转染与细胞培养试剂、基因型和蛋白检测试剂
  • 耗材:培养板和克隆耗材、低吸附核酸管、PCR 管板和枪头、单细胞分选或稀释耗材

必需对照与 QC

  • 未处理细胞
  • 非靶向向导对照
  • 阳性编辑对照
  • 多个独立克隆
  • 潜在脱靶位点检查
  • 对照表现符合预期;目标位点编辑经测序确认;单克隆身份、活率和支原体合格;至少两种层面验证功能;关键结论由独立克隆或救援实验支持。

关键参数与结果解释

向导序列和特异性、递送方式、细胞状态、Cas 与向导比例、供体设计、筛选压力和克隆扩增条件决定编辑效率与可解释性。

编辑率不等于功能敲除。需结合等位基因组成、转录本、蛋白表达、细胞表型和潜在脱靶影响解释结果。

常见问题

编辑低时重新设计向导并优化递送;活率低时降低剂量或调整恢复条件;克隆难扩增时优化培养和分选;表型不一致时检查嵌合、补偿通路和脱靶。

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科研用途说明:本流程仅用于科研实验设计和产品选型;具体参数、兼容性、规格、价格和交付以项目评估及正式报价为准。