化合物高通量筛选、命中确认与剂量反应全流程

建立可自动化、可量化且具有足够动态范围的细胞或生化检测体系,完成化合物初筛、命中确认、剂量反应和反筛。

实验目的

建立可自动化、可量化且具有足够动态范围的细胞或生化检测体系,完成化合物初筛、命中确认、剂量反应和反筛。

适用范围与实验要求

  • 样本:稳定细胞系与原代细胞
  • 样本:重组蛋白或酶体系
  • 样本:报告基因细胞模型
  • 样本:化合物库与机制对照物
  • 物种:不限,取决于靶点和模型来源
  • 难度与耗时:高级,约 1–4 周,取决于规模与验证层级
  • 安全:化合物按危害信息与溶剂要求管理;细胞、蛋白和自动化设备按实验室安全流程操作;废液分类处置。

实验原理

在微孔板中以标准化体系测量化合物对目标酶、受体、报告信号或细胞表型的影响,通过阳性/阴性对照计算动态范围与 Z 因子,并对候选命中进行复测、浓度梯度和正交验证。

标准工作流程

  1. 定义主要终点、命中阈值和反筛策略
  2. 优化试剂浓度、细胞密度与反应时间
  3. 通过小规模板验证动态范围和 Z 因子
  4. 执行化合物初筛并监测板位效应
  5. 复测初筛命中并排除信号干扰
  6. 建立浓度梯度并拟合剂量反应
  7. 使用正交实验和细胞毒性反筛
  8. 整理命中优先级、结构信息和复现证据

设备、试剂与耗材

  • 设备:自动化液体处理平台、多模式微孔板检测仪、细胞培养与计数设备、数据分析和板位追踪系统
  • 试剂:化合物库与机制对照、细胞培养或生化反应体系、活率、荧光或发光检测试剂、目标蛋白、底物和辅因子(按需)
  • 耗材:高质量微孔板、储液板与封板膜、低吸附枪头、化合物兼容耗材

必需对照与 QC

  • 最大信号对照
  • 最小信号或已知抑制剂对照
  • 溶剂对照
  • 无细胞/无酶背景
  • 板内质量控制样本
  • 板级 Z 因子和对照窗口达到预设;关键对照趋势稳定;重复孔和跨板变异受控;命中在独立复测中重现;剂量反应曲线满足拟合和效力标准。

关键参数与结果解释

Z 因子、信噪比、DMSO 耐受、加样精度、边缘效应、孵育时间、化合物溶解度和检测干扰决定筛选可靠性。

初筛命中仅代表在特定条件下改变读出。需排除荧光/发光干扰、聚集、溶解度、非特异毒性和靶点无关效应,并通过正交与机制实验确认。

常见问题与排错

板间漂移时校准液体处理和读板时序;边缘效应高时优化加湿与孵育;命中不复现时检查化合物身份和溶解度;假阳性多时增加干扰检测和无细胞反筛。

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