RNA 提取、纯化与完整性评估全流程

从细胞、组织和生物样本中获得适用于逆转录、RT-qPCR、RNA-seq 和杂交分析的高质量 RNA。

实验目的

从细胞、组织和生物样本中获得适用于逆转录、RT-qPCR、RNA-seq 和杂交分析的高质量 RNA。

适用范围与实验要求

  • 样本:培养细胞
  • 样本:新鲜或冻存组织
  • 样本:血液和体液
  • 样本:植物、微生物及低丰度样本
  • 难度与耗时:中等,约 1–3 小时
  • 安全:全程执行 RNase 控制;样本按来源进行生物安全管理;强变性剂和有机溶剂按化学品规范使用。

标准工作流程

  1. 快速稳定或冻存样本
  2. 充分均质并完成强变性裂解
  3. 分离并结合 RNA
  4. 执行柱上或溶液 DNase 处理
  5. 充分洗涤并干燥膜或磁珠
  6. 低体积洗脱并冰上操作
  7. 测定浓度、纯度和完整性
  8. 分装并低温保存

设备、试剂与耗材

  • 设备:生物安全柜或洁净操作区、微量离心机、组织均质设备、核酸定量和片段分析设备
  • 试剂:RNA 裂解与变性液、还原剂和 RNase 抑制剂、结合、洗涤与洗脱液、DNase 及反应缓冲液
  • 耗材:RNase-free 柱或磁珠、无 RNase 离心管和滤芯枪头、一次性研磨耗材、低吸附保存管

必需对照与 QC

  • 提取空白
  • RNA 阳性过程对照
  • -RT 对照
  • 外源 spike-in(按需)
  • 提取空白与 -RT 对照阴性;浓度和纯度满足用途;RIN、片段分布或电泳完整性达到预设标准;RT-qPCR 内参重复性可接受。

关键参数与结果解释

样本离体时间、稳定方式、均质效率、RNase 控制、DNase 处理、洗脱体积和冻融次数是关键变量。

RNA 质量应结合纯度、完整性、基因组 DNA 残留和实际逆转录扩增表现判断;不同样本的可接受阈值需按方法定义。

常见问题

降解时缩短处理时间并强化 RNase 控制;得率低时改善均质或匹配输入量;DNA 残留时优化 DNase;下游抑制时增加洗涤或二次纯化。

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科研用途说明:本流程仅用于科研实验设计和产品选型;具体参数、兼容性、规格、价格和交付以项目评估及正式报价为准。